Su construcción se inició en noviembre de 1883, un año luego de que el Observatorio Astronómico de París enviara instrumentos astronómicos a la ciudad de Bragado, Buenos Aires, para observar el tránsito de Venus por delante del Sol. Estos instrumentos fueron comprados por la Provincia de Bs. As. para observar el evento.
Algunos de los logros obtenidos por este observatorio fueron el descubrimiento del cometa Delavan y de la estrella Nova Puppis. Ademas realiza una gran labor astrométrica y registra datos meteorológicos y de variación de latitudes a lo largo de los años.
La investigación, en la que participan unos ciento veinte profesionales, entre investigadores, becarios y personal de apoyo, está organizada en departamentos o áreas especializadas en: Astrometría, Estructura Galáctica, Espectroscopía, Fotometría, Evolución Estelar y Mecánica Celeste, por el lado de la Astronomía; y Geofísica Aplicada, Geomagnetismo, Gravimetría, Sismología y Meteorología, por el lado de la Geofísica. Además se cuenta con el Área Técnica que comprende el departamento de Electrónica y el laboratorio de Óptica (LOCE). Las investigaciones teóricas y aplicadas que se desarrollan en estos departamentos, apuntan, en el área de la Astronomía, al estudio de las propiedades físicas de los astros y sus movimientos; las atmósferas, en base al análisis de sus espectros; análisis de la luz proveniente de los objetos celestes, etc.
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